La FEP est financée à l’aide de contribution des États membres de l’Union européenne, qui se sont engagés à financer en commun les actions de la Politique de sécurité et de défense commune de l’UE. 

Pour satisfaire à cette obligation, 21,4 millions d’euros de crédits de la provision interdépartementale ont été redistribués vers l’allocation de base « FEP ». L’on examinera par ailleurs comment garantir que le financement soit assuré de manière structurelle et durable à l’avenir.